При первом запуске современного GNOME (2.22+) следует запустить gconf-editor и убедится что выполнены следующие установки:
Apps -> Nautilus -> Desktop -> computer_icon_visible = off
-> home_icon_visible = off
-> network_icon_visible = off
-> trash_icon_visible = off
-> volumes_visible = off
-> Preferences -> always_use_browser = on
-> confirm_trash = on
-> enable_delete = on
-> media_automount = off
-> media_automount_open = off
-> media_autorun_never = on
gconftool-2 –type Boolean –set /desktop/gnome/interface/menus_have_icons True